隶属JR东、西日本，以及越后TOKIMEKI铁道。原本作为JR信越本线中一站，2014年伴随北陆新干线即将开业将候车大厅整体移动到现在的新站，并于2015年正式开业。为JR东西日本的分界站。1918年作为国有铁道信越本线中的一站开业，1949年归属国有铁道，2013年改名为上越妙高站，作为JR车站为两面四线路的高架车站，内部设有候车室、绿色窗口、自动售票机、VIEW PLAZA，便利店、餐饮店、COIN LOCKER、无障碍设施汽车租赁等服务。从新干线改票口出来向左侧行进便是妙高HANEUMA线改票口。作为越后TOKIMEKI铁道中一站，为一面两线路的地上车站。站周边东口设有租赁汽车公司、酒店、邮局、寺庙、神社等设施；西口设有教育设施、公园、停车场等设施。另外站东口还设有前往直江津、春日山站、佐渡等地的巴士。