京都交通的中心在JR京都站，西日本旅客铁道（JR西日本）、东海旅客铁道（JR东海）、近畿日本铁道（近铁）和市营地下铁乌丸线都通过这里，从这里前往滋贺县南部与大阪府北摄地区、奈良县北部地区的乘客亦很多。车站外是市巴士总站和长途及通宵巴士的站点，站内设有地下铁和巴士综合咨询处，还有出租车乘车点、运行线路图、乘车须知以及其它设施。

京都站是第1回“近畿车站百选”选定车站。京都站不仅是京都市的交通枢纽，建筑本身也非常有可看性。车站的设计理念是通过现代美感传达古都的历史，具有未来感的外观与京都的古意形成巨大反差。车站内部采用矩阵式的钢横梁顶，高45米的空中通道连接车站东西楼，还有171阶的巨大楼梯等标志，令人印象深刻。

车站大楼内有百货公司、酒店、餐厅、影院、游戏中心、政府办公场所、天台花园等设施。地下部分则销售各种京都土特产和工艺品，还有行李寄存处和邮政柜台，投币式储物柜分散在各处。京都站北口站前还有大型地下商业街。位于西侧十楼的“拉面小路”很有名，可品尝到日本不同地区的多种拉面。站内还有手冢治虫世界展览馆，有兴趣可以顺便参观。