伊佐尔波神社始建于平安时期，最早是在仲哀天皇与神功皇后行幸道后温泉的行宫基础上兴建的，因此这里主供的也是仲哀天皇与神功皇后，以及他们的儿子応神天皇。不过最初神社不在这里，而在道后公园里的汤筑城遗址上；而神社也得名于汤筑城所在地伊佐尔波冈。平安末年河野氏兴建汤筑城，就把神社迁到了现址。后几经兴替，直到安土桃山时代加藤嘉明入主松山城，为求松山城永固武运长久，兴建松山八社八幡，这里就是第一社，所谓汤月八幡宫。之后入主松山的松平氏第三代藩主，著名弓箭手松平定长在前往江户参加幕府将军举办的射术大赛前来这里祈愿，结果技压群雄一战成名；回到松山后立刻大兴土木对神社进行造替，也就有了现在伊佐尔波神社的规模。伊佐尔波神社的建筑非常有特点，本殿是全日本仅余三间的八幡造，同时本殿外回廊里还有各种历史悠久的绘马，以及和算试题，非常值得一探究竟。