马山由四个相连的山包组成，形如马鞍，故又称“马鞍山”，最高峰海拔211米。山上盛产安山玢岩，多为灰绿、灰褐色，为大约1亿年前岩浆涌出地表冷凝而成。除了四个相连的山包外，还另有一个小山丘，当地人习称“小土山”，其中一面如刀削斧剁般整齐地呈现出一个剖面，剖面的肌理是一道道直径约1米、高约30余米的灰绿色四方柱，远远望去，如同茂密的树林，所以被称为马山石林。崂山的山顶曾发现过海蛎子的化石，而马山上也有海蛎子化石，不过却是在马山的半山腰处，所以民间便有了“泰山云虽高，不及东海崂。崂山云虽高，只及马山腰”的歌谣。马山石林地处马山自然保护区内，保护区内地层单一，出露地层为白垩系莱阳群，主要岩性为紫红、黄绿色中细粒长砂岩、含砾砂岩夹砂砾岩、钙质粉砂岩、偶夹砂岩。同时马山山体还有沉积岩、火山岩、接触变质岩、动植物化石等多种地质资源。除此以外，保护区内还有云皇殿、白云庵、千佛洞等人文古迹。