国立台湾史前文化博物馆分为本馆和卑南文化公园两部份，本馆位于台东市康乐车站南方，基地面积约10公顷，卑南文化公园位于台东新站两侧，面积约18公顷。

史前馆的筹建缘于民国36年南迴铁路台东新站及调车场兴建工程，在卑南遗址的范围发掘出大量的石棺墓葬群。卑南遗址是台湾考古史上最完整的史前聚落遗址，更是东南亚及环太平洋地区最大的石板棺墓葬遗址。为保护此一珍贵的遗址，卑南遗址上的月形石柱经政府公告为一级古蹟，并规划成立国立台湾史前文化博物馆。然而，为减低建馆工程对遗址的伤害，将遗址地区规划为卑南文化公园，并将本馆兴建于南迴铁路康乐站之南侧，为台湾史前文化的保存与研究奠立持续发展的基础。

史前馆是国内博物馆中环境最为优美，展示最具本土特色的博物馆，其第一期展示让我们瞭解到台湾的自然史、史前史，及台湾南岛民族的文化与发展，充分展出台湾史前和原住民文化的菁华。而卑南文化公园是一座现地发掘、展示的遗址公园，园区裡有丰富多样的动植物生态，使公园成为一个环境再现的自然公园。