这座白色的教堂座落于马六甲市区，顶部为哥特式尖塔，是一座纪念“东方传道者”圣方济的教堂。圣方济于16世纪到东南亚传播天主教的教义，从马六甲开始，先后去到了印尼、印度、日本和中国，最终于中国病逝，他的遗体在运往印度的果阿安葬前，曾又在马六甲停放9个月等待季候风，期间又有了荷兰人不相信其肉身不腐而斩其右手的传说。如果仔细看，圣方济教堂有一点点歪斜，据说是二战时期日本人在附近投下一枚炸弹，没有炸到教堂，但是教堂却被震歪了一点，但至今还是很稳固的屹立着。现在的马六甲也有相当多的人信奉天主教，每个星期都有众多信徒前来教堂祷告。并且市内有几间天主教学校，这一切也都是全靠圣方济当年的传教所致。教堂内还拥有一些独特的圣物，比如唱诗班1930年购于法国的大风琴、圣方济的一块脚皮和他的一截骨头等。