秀姑峦溪发源於中央山脉的秀姑峦山，沿花东纵谷北流，於瑞穗乡东折，横切海岸山脉，而於大港口注入太平洋，全长约104公里，為台湾东部最大的河川，也是台湾唯一切穿海岸山脉的河川。秀姑峦溪切穿海岸山脉，切割出许多陡峭的峡谷，造成的曲流、河阶等地形景观，非常发达，是地质、地形的绝佳教室，又有〝秀姑漱玉〞之称。

秀姑峦溪下游，瑞穗到大港口段的秀姑峦溪峡谷，水道长约24公里，穿越二十多处激流、险滩，沿途峡谷雄伟、奇石林立，是台湾橡皮艇泛舟的热门去处；每年6-7月固定举行的秀姑峦溪泛舟观光活动，已成為最重要的泛舟活动。

位于瑞穗的泛舟服务中心是泛舟行程的起点，位于花东纵谷的瑞穗大桥之下，提供包括泛舟咨询、安全教育、生态保育在内的服务和功能。