埃姆登的实际建市日期已不可考，只能确定早在公元8世纪前已存在。在十六世纪时，埃姆登曾是宗教改革的中心。由于毗邻荷兰，又属滨海地区，埃姆登早于十七世纪，已是发达的城镇，曾专门为荷兰印刷圣经。