耶路撒冷位于以色列铁路网络中，但是它所处的线路——1892 雅法-耶路撒冷线Jaffa-Jerusalem，是以风景优美而非速度著名。从特拉维夫（Tel Aviv）可以搭乘火车到达耶路撒冷，终点站在耶路撒冷南部偏僻的Malkha火车站，有些火车也停在距Malkha火车站很近的Biblical Zoo站。从特拉维夫Merkaz/Savidor站到耶路撒冷Malkha火车站的车程为1.5小时左右，每小时一班，周日到周四始发5:54，末班车19:54；周五始发5:25，末班车14:25（夏季15:25）；周六始发5:25，末班车20:10（夏季22:10）。从Malkha火车站到Merkaz/Savidor站周日到周四始发5:44，末班车21:41（末班车只到Lod）；周五始发6:00，末班车13:56（夏季14:56）；周六始发6:00，末班车19:47（夏季21:47）。