金刚瑜伽母寺（Vajrayogini Temple）是加德满都谷地历史上位列第二的古老佛教寺院（第一是昌古纳拉扬寺），这里一共有两座寺庙，离入口最近的一座三层屋顶结构的寺庙里供奉的是金刚瑜伽母（Vajrayogini），中文称为瑜伽空行母。瑜伽空行母，裸体红色，一面两臂，怒面三眼。右手持金刚弯刀，左手持盛血颅器。本尊为怒面，表示解除邪见。红身表示能摄服天、地、人三界。佛经说，修持金刚瑜伽母，可消除一切恶障，顺利进行修习身、语、意三种瑜伽，能达到瑜伽三地，即证人无我瑜伽地、现证二取性空瑜伽地和现证谛实空瑜伽地，获得至高无上成就佛果。

金刚瑜伽母寺有着铜片覆盖的屋顶和镀金门廊，门廊两侧分列着巴依拉布、迦卢荼和神兽塑像，只有当祭祀为信众打开大门时，人们才能看到殿中供奉的神圣的金刚瑜伽母佛像。虽然名义上金刚瑜伽姆（瑜伽空行母）是一尊佛教菩萨，但整个庭院中到处可见印度教的神灵雕像。

主庭院中的另一座两层屋顶寺庙内供奉着一个纪念绿度母（Ugra Tara）的舍利塔，它是印度教版本的金刚瑜伽母，屋檐的撑杆装饰有佛教四大金刚的形象。 在这两座寺庙的南北两侧都有一些舍利塔和四面佛像、以及印度教的雕像，而两座寺庙之间的岩石代表蛇神纳迦，它的周围盘绕着一条石蟒。这里的一切醒目地展示着佛教和印度教的融合，所以这里是印度教和佛教徒共同的朝圣地。

这两座寺庙据说是普达拉普·马拉国王在1655年修建的，但边上的几处冥想石窟看上去年代更为久远，当时的人们曾经在这些石窟里修炼瑜伽功。